Las relaciones de cooperación con Guatemala se derivan del Convenio Marco de Cooperación Técnica y Científica, suscrito el 13 de julio de 1976, cuya entrada en vigor es desde el 16 de febrero de 1981.

Adicionalmente, se complementan estas relaciones en el marco de las estrategias regionales: Estrategia de Cooperación de Colombia con la Cuenca del Caribe, la Estrategia de Cooperación Internacional en Seguridad Integral, la Estrategia de Cooperación en Seguridad de Centroamérica - SICA y el Programa de Cooperación con Mesoamérica.